曹操此时虽有野心，也不过是想要“封狼居胥”而已，听闻此难如何能不震惊，大怒之下吩咐几人潜回城中，寻着机会于夜间打开城门，引大军入城。
当天晚上，曹操、朱儁、秦颉、孙坚四人领兵杀入城中，四人早已下了死命令，不留活口。似已官军只要见到头裹黄巾之人便杀，直杀得城中几无活人，赵弘、韩忠近20万黄巾兵，一个俘虏也没有留，全部被杀了个干净。
朱儁一面向朝廷上报功绩，一面派人北上，告知自己的朋友皇甫嵩。等诸葛瑾赶到南阳城中时，见到街上的血迹尚未清理干净，房屋更是倒塌无数，加之许多被焚烧过后的断壁残垣，城中真正是死气沉沉，满目苍夷。
后一天，前往南阳附近清剿黄巾军的官兵陆续回来，至此，南阳大平。至此，东汉末年，浩浩荡荡的黄巾起义，被镇压了。
第四十八章：计买官，坐拥青州
诸葛瑾赶到南阳，曹操等人出来接住，几人欢喜的寒暄几句，进入屋中坐下。
“孟德此战却是太过惨烈了，我来时一路上见到的尽是断壁残垣，这偌大的一个南阳城中，居然连些百姓也看不见了。”诸葛瑾刚刚坐下，便是说道。
曹操听了，回答道：“此事你却不知，南阳城中的百姓基本上被黄巾屠戮干净了……”