曾国藩之所以被任命为权大势重的两江总督，也是肃顺起的作用。在咸丰朝以前，两江总督例由满洲贵族担任，但是咸丰朝以后，基本上是由汉人担任，这与肃顺重用汉人的思想是分不开的。两江总督何桂清兵败被治罪，这个最重要的职位很多人都眼热。湖广总督官文更是视为囊中之物。就连胡林翼也认为，非官文莫属。早在道光末年就与曾国藩成为至交的莫友芝和其他一些官员商议，认为只有曾国藩才能胜任。高心夔此时在肃顺家中，就把这个建议告诉了肃顺。肃顺第二天向咸丰提议，四月，曾国藩就被任命为署理两江总督。六月，实授为两江总督，并且加钦差大臣衔。
从这一年开始，湘军的将领纷纷在仕途上崭露头角。短短一年之间，湘军的势力扩展到江南各个省份，几乎控制了除太平天国以外的所有省份。这固然是曾国藩等人拼命的结果，但也和肃顺的支持分不开。倘若没有这样大规模的任命，曾国藩想控制这么大的地方，恐怕是不可能的。