故事开始于1954年的纪录片，片中美国发现因为核武器而被唤醒、具有超强破坏力的巨兽哥斯拉，此后各国便联合展开所谓“君主计划”，以研究彻底消灭怪兽之方法      1999年菲律宾某矿区发生地震，参与“君主计划”的芹泽博士前往调查，在一陷坑中发现了虫形怪兽穆托的石化卵囊      同年，年幼地男主福特（亚伦·泰勒-约翰逊 饰）和在日本核电站工作的父母一起生活，...